Na parte estritamente fluvial, na sub-bacia internacional do rio Minho, é conhecida a presença de 24 espécies de peixes pertencentes a 14 famílias e repartidas em 18 espécies autóctones, das quais seis diádromas (incluindo a truta marisca), oito anfidromas e cinco residentes (incluindo a truta residente); e 6 espécies alóctones. Das espécies, 75% são autóctones; delas, 21% apresenta um importante valor de conservação, já que são espécies endémicas a nível peninsular.